ロミュランの陰謀
United | 宇宙暦：Unknown
アンドリアのシュラン司令官が、テラライトのグラル大使に命をかけた決闘を挑んだことから、アンドリアとテラライトの交渉は決裂する。しかしアーチャーは両者の同盟関係を守るために、グラルに代わって決闘を受けた。シュランとアーチャーは闘いを避けることはできない。
氷窟の民
The Aenar | 宇宙暦 : Unknown
ロミュランのドローン船は脳波によって遠隔操作されていることが分かった。その脳波は、アンドリア人の亜種で、テレパシーを使う、謎の種族イーナーのものと特定された。シュランとアーチャーは、その種族との接触に向かうが、それは危険なドラマの始まりだった。
クリンゴンの苦境
Affliction | 宇宙暦 : November 27, 2154
フロックスが、クリンゴン人によって地球から連れ去られ、あるウイルスの治療法を見つけるよう研究を強制された。そのウイルスは、優生クリンゴンを創り出す過程で発生したものである。リードはフロックスを救うために、重要な情報をアーチャーに明かさなかった。
優生クリンゴン
Divergence | 宇宙暦：Unknown
トリップと宇宙船コロンビア号も、新しいヘルナンデス船長の指揮の元、フロックスを求めてクリンゴン領内に入った。いっぽう、アーチャーはリードに対して秘密指令を明かすよう命令し、トゥポルはトリップに対して難しい問題を切り出した。