地底怪獣ホルタ
The Devil in the Dark | 宇宙暦：3196.1
ジェナス6号星で鉱山の作業者たちを殺し、機材を壊した謎の怪物を調査していたカークとスポックは、岩石状の生物を発見した。スポックはその生物と精神融合を行う。
クリンゴン帝国の侵略
Errand of Mercy | 宇宙暦：3198.4
クリンゴン帝国と連邦との板ばさみで危険にさらされたオルガニア星の住民を守るために、カークとスポックは仲介を試みるが、驚いたことにオルガニア人たちには危機感がまったくなかった。
二つの宇宙
The Alternative Factor | 宇宙暦：3087.6
宇宙空間に突如起こった衝撃を調査していたエンタープライズは、ラザラスという男に出会った。彼はまったく異なる2つの人格を持っていた。
危険な過去への旅
The City on the Edge of Forever | 宇宙暦：3134.0
誤って薬を大量に注射してしまったマッコイは情緒不安定になって、時の門に飛び込んでしまった。それは地球の歴史の流れに重大な影響を与える可能性がある。それを防ぐために、カークとスポックも後を追って1930年代の地球に向かった。